NARUTO Powerful Shippuden incluye un modo Historia y un modo Endless Battle en el que disfrutar de un número ilimitado de combates, por lo que los jugadores podrán elegir entre seguir la historia o, simplemente, enfrentarse a infinidad de ninjas en intensos combates. El estilo de juego, cargado de acción, permite a los jugadores ganar puntos de experiencia con los que potenciar a sus vivaces personajes y, además, usar la pantalla táctil para fortalecer los ataques especiales. Los aficionados reconocerán a sus personajes favoritos de la franquicia NARUTO, tales como Kakashi, Sakura, Gaara y muchos más; todos ellos hacen las veces de personajes de apoyo a los que podremos pedir ayuda en medio del combate. Con caras conocidas a su lado y con un buen puñado de movimientos ninja en la manga, los jugadores se embarcarán en una aventura cuyo objetivo será convertirse en un poderoso ninja de la Hoja capaz de vencer a todos sus rivales… o capaz de dominar la técnica erótica.