Pocos meses después de los sucesos de Inazuma Eleven 2, Mark Evans y sus compañeros son convocados por su entrenador. Éste ha sido encomendado con la tarea de seleccionar el mejor equipo nacional para luchar por el campeonato mundial con las mejores selecciones de todo el mundo.

Características

• El juego se lanza en dos versiones: Inazuma Eleven 3: Fuego Explosivo e Inazuma Eleven 3: Rayo Celeste. El reto es similar, pero la historia varía porque se cuenta desde el punto de vista de un equipo diferente que se enfrenta a rivales distintos. Además, cada versión cuenta con 33 personajes únicos así como técnicas y habilidades que no podrán encontrarse en la otra edición a no ser que los usuarios los intercambien entre ellos.
• La tercera parte del juego usa una mecánica muy similar a la de la licencia Pokémon con coleccionismo, intercambio, mezcla de rol y estrategia.... y partidos de fútbol usando la pantalla táctil. Pero incorpora novedades como movimientos especiales que realiza el equipo completo...
• El juego cuenta con más de 2.000 futbolistas (el doble de las anteriores entregas) con habilidades nuevas para que el jugador cree su selección.
• El multijugador permite competir a cuatro jugadores.
• La función StreetPass permite recibir datos de los equipos de otros jugadores con los que el usuario se cruce y enfrentarse a ellos en el terreno de juego: en caso de ganar recibiría recompensas.
• En el futuro se podrán descargar nuevos personajes e items mediante SpotPass.
• Totalmente doblado al castellano con las voces de la serie de televisión.